近几年来，珠江流域持续干旱，受上游来水偏枯、下游河道变化加速、城市用水增加等因素的共同作用，珠江三角洲咸潮上溯愈发强烈，接连发生严重咸潮，极大威胁到澳门、珠海两地的供水安全。
2006年12月29日，国务院总理温家宝在会见澳门特别行政区行政长官何厚铧时说，“在谈工作之前，有件事我最关心，就是因为咸潮的影响，给珠海、澳门市民用水带来许多困难。中央政府十分关心此事，有关部门和广东省正在采取措施，努力加以解决，不仅采取应急方案解决今年的问题，而且要做长远的规划解决长久的问题。”
澳门及珠江三角洲地区受咸潮之困问题不仅引起澳门人大代表和社会各界的广泛关注，中央政府更是高度重视。为解决澳门供水问题，温家宝总理明确批示，要求水利部研究制定解决澳门供水的长效之策。全国人大常委会也将澳门特别行政区全国人大代表团《关于长远解决咸潮影响澳门供水问题的建议》（第3679号）列为2006年重点建议，并责成水利部牵头会同国家发展改革委负责建议的办理工作。
2006年底和2007年3月７日，水利部原部长汪恕诚分别向全国人大常委会和澳门全国人大代表团报告解决珠江河口地区咸潮问题以及保障澳门、珠海供水安全等有关工作情况。2007年6月初，水利部矫勇副部长在澳门向全国人大代表、政协委员和社会各界作《关于解决澳门供水问题的报告》时，阐述了长效解决澳门供水问题的对策与措施：包括加快完善澳珠供水体系，按照发电服从调水的原则建立枯水期流域水量调度机制，加大节水防污型社会建设力度，建设大藤峡水利枢纽提高流域水资源调控能力，加强珠江河口的河道管理等。并指出：在近期工程全面完成并发挥效益之前，每年要做好冬春季节水情预测和骨干水库调度预案，充分利用平岗泵站扩建工程已经发挥效益和龙滩水库已经下闸蓄水的有利条件，制定保证澳门供水的安全措施，目标是使澳门同胞冬春季节不再受咸潮之苦。
据国家气象局和水文部门预测，今年珠江流域来水量较常年明显偏少，属于偏枯年份，珠江三角洲地区咸潮上溯仍将严重，且光照、长洲等大型水电站计划下闸蓄水，龙滩电站也正值初期蓄水阶段，都将进一步减少枯水期西江干流径流量，加剧河口咸潮上溯，澳门及珠江三角洲地区仍然面临严峻的供水形势。与此同时，澳门旅游和娱乐业迅速发展，今年下半年大型酒店及娱乐设施相继营业，澳门用水量剧增20%，因计划中的第三条输水管道还未建，目前只有通过保持对澳供水的南屏、竹仙洞两个水库长期高水位运行，以增大输水水头，从而提高输水量，来满足澳门用水需求，此举将减少保障澳门、珠海供水的南库群总有效调节库容近30%，如不实施2007～2008年枯水期珠江水量统一调度，统筹安排光照、龙滩、长洲在建工程的下闸和蓄水，实施流域径流调配，将难以保证澳门及珠江三角洲地区供水安全。
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