1、主流西江缺乏控制性防洪工程调控洪水
    西江水系集雨面积35.31万km2，占西、北江流域面积的88.3%，珠江的洪水威胁主要来自西江。但是，西江中下游无天然湖泊调蓄洪水，《珠江流域综合利用规划报告》中所确定的控制性防洪水库，除干流的龙滩水电站、支流郁江的百色水利枢纽已开工建设外，其他均未兴建，沿江防洪只能依靠单一的堤防工程，缺乏调控大洪水的有效手段，中下游及三角洲地区的防洪压力极大。

    2、堤线长、隐患多、标准低、风险大
    珠江的堤防总长1.2万多km，普遍存在着堤高不够、堤身单薄的问题，大部分堤防（包括北江大堤等重点堤防）不同程度地存在渗水、冒沙及穿堤建筑物老化失修等隐患，许多堤段的防洪能力长期处于10年～20年一遇的水平，还有相当一部分堤防仅能防御10年一遇以下的洪水。近年来，随着上游地区堤防建设步伐的加快，洪水归槽现象日趋明显，加大了下游地区的防洪压力，加之堤线长、防守难，防洪风险不断增加，防洪形势十分严峻。
 

   3、城市防洪建设滞后，防洪能力低
    城市防洪是珠江流域的防洪重点，但规划范围内的广州、南宁、梧州、柳州等国家重点防洪城市的城区防洪工程体系均未形成，其中，南宁市的防洪能力仅约20年一遇，柳州市的堤防工程尚在建设中，梧州市河东区连年受淹的状况仍未改变，深圳、桂林、曲靖等一批大中城市的防洪（潮）堤也未达标，部分县以上城市甚至还未设防，城市防洪能力亟待提高。

    4、病险水库多，除险任务重
    珠江流域现有大型水库40座，中型水库348座，有29%的大、中型水库存在比较严重的安全隐患（三类病险库）。病险水库中，有多达44座对县级以上城镇构成直接威胁，还有一批中型水库位于重要的交通干线附近，一旦失事，后果不堪设想。因此，必须尽快完成病险水库的除险加固，确保水库的安全运行。
   

    5、河道设障、河口泄洪不畅
    侵占河滩地、无序围垦、违章建设涉水建筑物及滥采河砂、向河中倾倒废弃杂物、砂石的现象时有发生，影响了河道泄洪功能的正常发挥及洪水的畅泄入海，加重了局部地区的防洪压力。此外，珠江三角洲网河区及出海口门区的人类活动对防洪造成的影响也较为突出。

    6、水土流失严重，山地灾害频繁
    珠江流域的水土流失面积达5.71万km2 ，占流域国土面积的12.59%。水土流失恶化了流域的洪水情势，进一步加重了流域的防洪压力。同时，上游地区的山地灾害时有发生，严重威胁当地居民的生命财产安全。由于治理资金相对不足，治理工作进展缓慢。
 

    7、非工程防洪措施亟待加强
    国家《防洪法》颁布实施以来，与之配套并适合珠江实际的法规体系尚未建立，流域性的水文遥测站网、洪水预报预警系统及防洪决策支持系统亦未形成，防洪管理不适应防洪建设的要求，蓄滞洪区的减灾措施与补偿政策研究不够，个别重点城市的超标准洪水防御措施有待落实。非工程防洪措施的滞后，往往使防洪指挥决策陷入被动，给防洪抢险带来不利。